1895年4月17日，丧权辱国的中日《马关条约》签定，将台湾和澎湖列岛割让给日本，这不啻给刘铭传当头一棒。他忧思郁结，旧病增剧，于第二年不治去世。作为一名有爱国心的沙场老将，最令他抱恨终天的是：不能驰赴疆场，抗击日寇，而是眼睁睁看着多年呕心沥血建设的台湾宝岛被拱手割予日本。
其实在台湾还有一位与刘铭传齐名的百战宿将，他就是赫赫有名的黑旗军首领刘永福。
1894年7月，甲午战争爆发。因台湾地理位置重要，清政府命刘永福赴台，帮同台湾巡抚邵友濂办理防务。8月，刘永福率两营黑旗军赴台北，后又奉令移驻台南，将所部增至八营，仍称黑旗军。
1895年4月，清政府战败求和，与日本签订《马关条约》，把台湾全岛及附属各岛屿割让给日本。6月初，日军由三貂角澳底登陆进逼台北。刘永福在台南草拟了《盟约书》，发出联合抗日的号召。表示为保卫国土，“万死不辞”，“纵使片土之剩，一线之延，亦应保全，不令倭得”。6月7日，日军陷台北，6月28日，台湾地方绅民推举“六夜言情”更新最快,全刘永福继任百度搜索本书名+看最快更新台湾总统，领导抗日。刘永福不受，仍以帮办之职，入府城领导台湾人民抗战。将全台各军，及各地义军百数十营，分别调遣巡防各要隘，并派人接替“内渡”大小文武各官的职务，积极领导全台的抗日斗争。
日军占领台北后，随即南下入侵新竹。刘永福令副将杨紫云统领新楚军会同台湾生员吴汤兴、姜绍祖、徐骧等领导的台湾义民军与日军相持月余，大小二十余战，歼灭大量日军。8月初，黑旗军联合徐骧等义民军会攻新竹，连获大捷。8月23日，日军大举反扑失败，吴彭年率黑旗军穷追不舍。刘永福闻讯，急电各营：“胜不可恃，恐防倭人由僻径渡大甲溪”。并急令忠满等率数营星驰赴援漳化。果不出刘永福所料，忠满还未到彰化，大甲溪已失。吴彭年率军退守彰化城北八卦山。
台中失陷，吴彭年与将士约定，誓死于台湾共存亡。在彰化城中，义军日夜巡逻，附近农民有的前来参军，有的送粮送菜，支援义军作战。
8月26日，日军占领台中城后，倾全力南攻彰化。义军在彰化城东的八卦山同敌寇展开惊心动魄的血战。这是台湾人民抗日斗争史上最激烈的一次战斗。
八卦山是俯瞰彰化城的制高点和拱卫彰化城的天然屏障，形势险要，距城东仅1公里。当时防守彰化的部队，除了从各战场聚集来的各路义军外，还有许多地方武装，共约3600人。在日军进攻前，义军的防御部署是：王德标、刘得胜各率部守中寮庄；徐骧、吴汤兴、汤人贵、罗树勋等率部守八卦山，李惟义守彰化城。
8月27日，日军近卫师团主力分三路向义军进攻。右路两个大队由陆军少将川村率领；左路两个联队由陆军少将山根率领；中路三个大队由北白川官能久亲王率领。战斗发起后，日军头目隔大肚溪侦察八卦山方面抗日军队的阵地，守卫八卦山的义军一发现敌人，立即发炮。敌人猝不及防，少将山根和中佐绪方等官佐中炮，伤重毙命。激战一天，敌人没能前进一步。黄昏，日军大队强渡大肚溪，徐骧等利用夜幕，进行袭击，歼灭了不少敌人。
到了夜里，日军左路从大竹庄附近山谷僻径，悄悄爬上八卦山，匍匐到山地。
28日晨，当义军发现时，敌军已布满山谷，并接近八卦山东侧高地。敌精税部队近卫师团千余人用快枪快炮环攻。抗日军英勇战斗，不怕牺牲，拼死肉搏。汤人贵、李士炳、沈福山等率部扑向日军，与敌人展开了白刃格斗。八卦山上炮火连天，硝烟弥漫，杀声震野，双方为争夺八卦山阵地展开了殊死战斗。义军首领吴汤兴、汤人贵、李士炳、沈福山等壮烈殉国。林鸿贵率黑旗军冲锋队七星队百余人冲入敌阵，夺吴汤兴遗体，又相继死难。
当徐骧率部且战且退，突出重围时，吴彭年正率部在大肚溪南岸的菜光寮同日军右翼部队激战，吴彭年左手握枪，右手抡大刀，率领黑旗军奋力抗击。战斗正酣之际，吴彭年遥望八卦山已挂日旗，才知八卦山阵地已失。吴彭年身先士卒，急年七星队―黑旗军的敢死队驰往救援。半路上汇合了从山上退下来的徐骧余部，又像猛虎一样冲上山去。冲在最前面的是林鸿贵率领的黑旗军一个小队，他们奋勇登上山头，与日军白刃相搏，大创日军。
日军依靠人多，将七星队团团围住，四面环攻。抗日军浴血苦战，吴彭年身受重伤，和七星队战士们带伤力战，最后全部战死在八卦山头，实践了吴彭年宁死不肯放弃神圣海疆的誓言。徐骧率20多人杀开一条血路，突出重围，退往台南。
日军付出了惨重代价，才占领了八卦山。台湾军民在彰化八卦山战役中前仆后继，表现了有我无敌、血战到底的英雄气概。八卦山争夺战是整个反割台斗争中最为壮丽的一场战斗。
日军占领八卦山后，居高临下，炮击彰化城。城里秩序大乱，日军乘势进攻。城内老幼妇孺出西门避难，迎面遇到日军，尽遭残杀。汉奸开彰化城门迎敌。日军入城后，守城义军与敌巷战半日，守将李仕高、沈仲按、杨春发在巷战中全部殉难。29日，彰化陷落。
就在彰化失守的当天，日军乘义军败退之机，迅速抢占了鹿港。此后，日本近卫师团按照桦山资纪的命令，除向台南方向搜索警戒外，暂停向南进军，避免孤军深入，遭受损失。
彰化失守，嘉义吃紧，台南震动。8月30日，日军攻占云林，进军大莆林。刘永福亲赴嘉义前敌诸营，令王德标率七星队坚守嘉义，令副将杨泗洪率五营奔赴前敌，发动当地民众，组织武装，抗日自卫。同时派人联络附近的简精华、黄荣邦、林义成等义军，共同抗击。
在此危急关头，刘永福亲赴嘉义前敌诸营，指授兵机。又令部将王得标守嘉义城，令部将杨泗洪节制前敌黑旗军各营及各地义军组织进攻。各路义军密切配合，连获大捷，相继收复云林、苗栗，进至彰化，军威复振。但此时，台湾抗战各军饷械均已告謦，刘永福派人回内地筹饷，仅敷前营伙食，后来连伙食也发不出。刘永福悲叹“内地诸公误我，我误台民！”
9月11日，日军增援台湾的第二师团到达台北，在海军配合下，大举南犯。10月9日攻陷嘉义。10日和11日，日军在布袋嘴和枋寮登陆，分兵进逼台南。15日，日舰进攻台南东南的打狗港。刘永福派其子刘成良率军抗击。守军饥甚馈散，刘成良退守台南。这时，刘永福曾写信给桦山资纪，“建议息兵”，“希望和议”。但被拒绝。
10月18日，刘永福召众将会议，商议战守之计，未得结果。当天，守军无食，大部溃散。19日，日军大举进攻安平炮台，刘永福亲自登台发炮，毙敌甚多。当晚，日军攻城益急，城内土匪蜂起，秩序大乱看最快更新刘永福想回城内，部将劝阻：“军心散矣，各路倭兵大至，此城万不可守，请公去”。刘永福见大势已去，仰天椎胸，呼号恸哭说：“我何以报朝廷，何以对台民！”遂密乘英轮“多利士”号退回大陆。21日，日军占领台南。至此，刘永福领导的台湾抗战宣告失败，台湾抗战虽然失败了，但刘永福领导台湾军民在外无救援，内缺粮饷的极其困难局面下，坚持4个多月的浴血奋战，英勇地抗击了日军两个近代化师团和一个海军舰队的进攻，沉重地打击了侵略者。侵台日军共5万人，因伤亡和疾病减员达三万两千人，其中在台丧命者4600人。侵台日军头目，近卫师团长、陆军中将北白川能久亲王、第二旅团长、陆军少将山根信成也被台湾军民击毙。
刘永福内渡后，1902年署广东碣石镇总兵。1911年广东**后，被推为广东民团总长，后辞职回籍，1915年，日本向袁世凯提出灭亡中国的二十一条，将近80岁的刘永福义愤填膺，要求重上战场。1917年1月，病逝于家，葬于惠州城内西湖畔。
